Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms