Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Krt77Q6IFZ6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Krt77Q6IFZ6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Krt77Q6IFZ6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Krt77Q6IFZ6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Krt77Q6IFZ6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Krt77Q6IFZ6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Krt77Q6IFZ6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Krt77Q6IFZ6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Krt77Q6IFZ6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Krt77Q6IFZ6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Krt77Q6IFZ6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms