Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KdsrQ6GV12 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KdsrQ6GV12 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KdsrQ6GV12 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KdsrQ6GV12 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KdsrQ6GV12 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KdsrQ6GV12 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KdsrQ6GV12 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KdsrQ6GV12 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KdsrQ6GV12 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KdsrQ6GV12 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KdsrQ6GV12 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KdsrQ6GV12 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KdsrQ6GV12 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KdsrQ6GV12 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KdsrQ6GV12 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KdsrQ6GV12 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms