Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Smarca2Q6DIC0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms