Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nop58Q6DFW4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms