Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZX8

Ablim3, Actin-binding LIM protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ablim3Q69ZX8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ablim3Q69ZX8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ablim3Q69ZX8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms