Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Pdzrn3Q69ZS0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Pdzrn3Q69ZS0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Pdzrn3Q69ZS0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Pdzrn3Q69ZS0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Pdzrn3Q69ZS0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Pdzrn3Q69ZS0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Pdzrn3Q69ZS0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Pdzrn3Q69ZS0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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