Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms