Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms