Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms