Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q66JV7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q66JV7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q66JV7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q66JV7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q66JV7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q66JV7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q66JV7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q66JV7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q66JV7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q66JV7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q66JV7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q66JV7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q66JV7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q66JV7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q66JV7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q66JV7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q66JV7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q66JV7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q66JV7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q66JV7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q66JV7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q66JV7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q66JV7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q66JV7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms