Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms