Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PtprdQ64487 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PtprdQ64487 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PtprdQ64487 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PtprdQ64487 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprdQ64487 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PtprdQ64487 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PtprdQ64487 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms