Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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