Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms