Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms