Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall3Q62255 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms