Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six3Q62233 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms