Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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