Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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PtprrQ62132 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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PtprrQ62132 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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PtprrQ62132 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PtprrQ62132 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PtprrQ62132 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PtprrQ62132 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PtprrQ62132 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PtprrQ62132 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PtprrQ62132 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PtprrQ62132 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PtprrQ62132 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PtprrQ62132 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PtprrQ62132 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PtprrQ62132 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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