Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prkd1Q62101 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prkd1Q62101 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prkd1Q62101 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prkd1Q62101 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd1Q62101 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd1Q62101 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd1Q62101 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd1Q62101 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd1Q62101 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd1Q62101 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd1Q62101 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd1Q62101 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms