Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms