Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msi1Q61474 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms