Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms