Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abcd2Q61285 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms