Protein–RNA interactions for Protein: Q61146

Ocln, Occludin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OclnQ61146 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OclnQ61146 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OclnQ61146 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OclnQ61146 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms