Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms