Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usf1Q61069 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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