Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms