Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms