Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms