Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms