Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms