Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms