Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema5bQ60519 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms