Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a3Q5XF89 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a3Q5XF89 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a3Q5XF89 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a3Q5XF89 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a3Q5XF89 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a3Q5XF89 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a3Q5XF89 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a3Q5XF89 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a3Q5XF89 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms