Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms