Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms