Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms