Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms