Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prune2Q52KR3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms