Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms