Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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