Protein–RNA interactions for Protein: Q497J0

BC100530, MCG130175, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC100530Q497J0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BC100530Q497J0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms