Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28bQ45KJ6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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