Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx25Q3ZT31 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx25Q3ZT31 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms