Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Lrrc43Q3V0L5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Lrrc43Q3V0L5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Lrrc43Q3V0L5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Lrrc43Q3V0L5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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