Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms