Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed1Q3V009 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms