Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Prdm6Q3UZD5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Prdm6Q3UZD5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Prdm6Q3UZD5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Prdm6Q3UZD5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Prdm6Q3UZD5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Prdm6Q3UZD5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Prdm6Q3UZD5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Prdm6Q3UZD5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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